Zestawy testowe na COVID-19 zmierzą mikrobiom jamy ustnej

Zestawy testowe COVID-19, które zawierają środki konserwujące, mogą być stosowane do określenia mikrobiomu jamy ustnej. Ponadto testy te są pomocne w wykazaniu związku pomiędzy mikrobiomem jamy ustnej a chorobą COVID-19.

Takie wnioski można wyprowadzić z artykułu pt. „Ocena metod zbierania i przetwarzania mikrobiomu śliny” (Assessing saliva microbiome collection and processing methods). Został on opublikowany w listopadzie br. w czasopiśmie „NPJ Biofilm and Microbiomes”.

Analiza genomu pod lupą naukowców

Autorzy badania związani z Centrum Zaawansowanej Biotechnologii i Medycyny (CABM) na Uniwersytecie Rutgersa – Uniwersytecie Stanowym New Jersey (USA) pobrali 56 próbek śliny pochodzących od 22 osób i przeprowadzili na nich analizę genomową. Jak podali, badanie to było pierwszym, które testowało precyzję pomiarów bakterii jamy ustnej w domowych testach na COVID-19, w których używa się śliny.

– Poddając analizie mikrobiom jamy ustnej w próbkach od pacjentów z lub bez COVID-19, możemy dowiedzieć się, w jaki sposób środowisko mikrobiologiczne w jamie ustnej i płucach może wpływać na przebieg tej choroby – podała w komunikacie prasowym główna autorka badań dr Abigail Armstrong z CABM.

Przeprowadzając sekwencjonowanie genów na próbkach w celu obserwacji różnorodności mikrobiomu, badacze wykorzystali próbki śliny zarówno z konserwantami, jak i bez nich.

Materiał genetyczny bakterii w domowych testach na COVID-19

Jak stwierdzili naukowcy z zespołu dr Armstrong, próbki śliny z zestawów testowych na COVID-19, które zawierają środki konserwujące (dzięki nim udaje się zachować RNA SARS-CoV-2), pozwoliły na dokładne pomiary bakterii obecnych w jamie ustnej uczestników. Próbki z zestawu testowego na COVID-19 dały również bardziej stabilny obraz mikrobiomu w porównaniu z próbkami zebranymi w zestawach, które nie zawierały konserwantów.

Do czasu tego badania naukowcy nie dysponowali wiedzą, czy domowe testy na COVID-19 zachowują materiał genetyczny bakterii. Wyniki badań potwierdziły możliwość przeprowadzenia analizy mikrobiomu jamy ustnej za pomocą domowych testów COVID-19. – Wykonana praca umożliwiła nam ocenienie wielu próbek śliny pobranych od uczestników testu na Uniwersytecie Rutgersa, którzy zgłosili się do udziału w badaniach nad COVID-19 – napisał inny autor artykułu, dr Martin Blaser, dyrektor CABM.

- Nawyk mycia rąk przyczynił się do zmniejszenia częstości występowania tzw. chorób brudnych rąk - mówi dr Tomasz Dzieciątkowski, wirusolog, którego zapytaliśmy o to, co pandemia może zmienić w naszym życiu, kiedy już uda nam się ją skutecznie opanować.

T.H.

źródła: https://www.drbicuspid.com/index.aspx?sec=sup&sub=hyg&pag=dis&ItemID=329700

https://www.nature.com/articles/s41522-021-00254-z